2016年的清明小長假運輸4天（1日-4日），累計發送旅客14.57萬人,加班739輛次。運量和營收與去年同期相比雖仍有所下降，但情況都好于預期。
   清明節當天下午東、西兩站出現了突發性的客流井噴現象，前往蘇州、無錫、常州、南京、鎮江、淮安、泰州、泰興、高郵、興化、南通等地的旅客高度密集在車站候車，對此，集團 公司假日辦現場指揮，統籌調集車輛，及時安插加班，設法疏運旅客，截止當晚八點半左右車站的旅客才陸續疏運結束。經統計4日全天發送旅客3.66萬人，臨時加班245輛次。
   分析清明當天下午客流短時期內發生井噴的原因有兩個方面：一是受2日發生在滬蓉高速常州段的事故影響，選擇乘坐大巴出行的旅客明顯增多;二是由于清明節處于小長假末期，回鄉祭祖的旅客選擇下午返程離揚，致使當天發生上午客流平淡，下午客流井噴這種極不對稱現象。